Un gruppo di ricercatori dell'Università della California ha scoperto un nuovo tipo di elementi extracromosomici (ECE, elemento extracromosomico) che vivono all'interno di microrganismi unicellulari - archaea che metabolizzano il metano. Un documento che descrive i loro risultati è disponibile sul server di prestampa bioRxiv.
Gli elementi extracromosomici sono tipi di DNA che esistono al di fuori dei cromosomi. Includono virus e plasmidi e di solito conferiscono alcuni vantaggi all'ospite. Nel caso dei virus, gli ECE tendono a contrastare gli attacchi batterici. In questo nuovo studio, i ricercatori hanno cercato ECE che potrebbero essere utili per abbattere il metano nel suolo, che è un mezzo per ridurre le emissioni di gas serra dalle operazioni agricole.
Il loro compito era scavare il terreno e prelevare campioni degli organismi che vi abitavano. Durante la ricerca di campioni, si sono imbattuti in un ECE che non avevano mai visto prima. La caratteristica unica più notevole di ECE era la sua dimensione; i campioni erano da 600.000 a 1 milione di paia di basi.
Gli elementi extracromosomici erano così grandi da rappresentare quasi un terzo della lunghezza del DNA del loro ospite, un archeo chiamato Methanoperedense. I ricercatori hanno anche scoperto diverse varietà di ECE, a cui hanno dato il nome di fiori come "lillà" o "oliva". Ad oggi sono state trovate 23 varianti.
Gli scienziati hanno scoperto che l'ECE aveva diverse coppie di basi ad entrambe le estremità delle catene, nonché siti di replicazione. Inoltre, hanno trovato frammenti del genoma dell'ospite nelle catene ECE. Il team ha quindi cercato nel database, confrontando il nuovo ECE con altri DNA e trovando diverse corrispondenze.
I ricercatori ipotizzano che gli elementi extracromosomici ricevano frammenti di DNA da altri organismi che incontrano, spingendoli a chiamarlo Borg, dopo i cyborg di Star Trek.
I ricercatori hanno notato che la raccolta di pezzi di DNA da altri organismi richiede uno sforzo, il che suggerisce uno scopo. Ipotizzano che i Borges stiano cercando e usando il DNA per aiutarli a ossidare il metano. Pensano anche che le loro grandi dimensioni suggeriscano che un tempo esistessero come plasmidi o virus.
Il lavoro è stato pubblicato sul server di prestampa bioRxiv.
2021-07-27 05:06:44
Autore: Vitalii Babkin