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メタン代謝古細菌に見られる巨大な染色体外要素

メタン代謝古細菌に見られる巨大な染色体外要素

カリフォルニア大学の研究者グループは、単細胞微生物の内部に生息する新しい種類の染色体外要素(ECE、染色体外要素)、つまりメタンを代謝する古細菌を発見しました。それらの結果を説明するドキュメントは、bioRxivプレプリントサーバーで入手できます。

染色体外要素は、染色体の外側に存在するDNAの種類です。それらにはウイルスやプラスミドが含まれ、通常は宿主にいくつかの利点をもたらします。ウイルスの場合、ECEは細菌の攻撃に対抗するのに役立つ傾向があります。この新しい研究では、研究者たちは土壌中のメタンを分解するのに役立つ可能性のあるECEを探しました。これは、農業活動からの温室効果ガス排出を削減する手段です。

彼らの仕事は、土壌を掘り起こし、そこに生息する生物のサンプルを採取することでした。サンプルを探しているときに、彼らは今まで見たことのないECEに出くわしました。 ECEの最も注目すべきユニークな特徴はそのサイズでした。サンプルは60万から100万塩基対でした。

染色体外要素は非常に大きかったため、宿主のDNA長のほぼ3分の1を占めていました。これは、Methanoperedenseという古細菌です。研究者たちはまた、「ライラック」や「オリーブ」などの花にちなんで名付けられた、いくつかの種類のECEを発見しました。現在までに、23のバリエーションが見つかりました。

科学者たちは、ECEが鎖の両端と複製部位に異なる塩基対を持っていることを発見しました。さらに、彼らはECE鎖に宿主ゲノムの断片を発見しました。次に、チームはデータベースを検索し、新しいECEを他のDNAと比較して、いくつかの一致を見つけました。

研究者たちは、染色体外要素が遭遇する他の生物からDNAフラグメントを受け取り、スタートレックのサイボーグにちなんで彼をボーグと名付けるよう促したと推測しています。

研究者たちは、他の生物からDNAの断片を収集するにはある程度の努力が必要であり、これは何らかの目的を示唆していると指摘しました。彼らは、ボルヘスがメタンの酸化を助けるためにDNAを探し、使用していると推測しています。彼らはまた、彼らの大きなサイズは、彼らがかつてプラスミドまたはウイルスとして存在していたことを示唆していると考えています。

作品はbioRxivプレプリントサーバーで公開されました。


2021-07-27 05:06:44

著者: Vitalii Babkin

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