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메탄 대사 고세균에서 발견되는 거대한 염색체 외 요소

메탄 대사 고세균에서 발견되는 거대한 염색체 외 요소

캘리포니아 대학(University of California)의 연구원 그룹은 메탄을 대사하는 고세균인 단세포 미생물 내부에 사는 새로운 종류의 염색체외 요소(ECE, extrachromosomal element)를 발견했습니다. 결과를 설명하는 문서는 bioRxiv preprint 서버에서 사용할 수 있습니다.

Extrachromosomal 요소는 염색체 외부에 존재하는 DNA 유형입니다. 여기에는 바이러스와 플라스미드가 포함되며 일반적으로 숙주에 몇 가지 이점을 제공합니다. 바이러스의 경우 ECE는 박테리아 공격에 대응하는 데 도움이 되는 경향이 있습니다. 이 새로운 연구에서 연구원들은 농업 작업에서 온실 가스 배출을 줄이는 수단인 토양에서 메탄을 분해하는 데 유용할 수 있는 ECE를 찾았습니다.

그들의 임무는 토양을 파고 그 안에 살고 있는 유기체의 샘플을 채취하는 것이었습니다. 샘플을 검색하는 동안 그들은 전에 보지 못했던 ECE를 우연히 발견했습니다. ECE의 가장 눈에 띄는 독특한 특징은 크기였습니다. 샘플은 600,000에서 100만 염기쌍이었습니다.

염색체 외 요소는 너무 커서 Methanoperedense라는 고세인 숙주의 DNA 길이의 거의 1/3을 차지했습니다. 연구원들은 또한 "라일락" 또는 "올리브"와 같은 꽃의 이름을 따서 명명한 여러 종류의 ECE를 발견했습니다. 현재까지 23개의 변형이 발견되었습니다.

과학자들은 ECE가 사슬의 양쪽 끝과 복제 부위에 서로 다른 염기쌍을 가지고 있다는 것을 발견했습니다. 또한, 그들은 ECE 사슬에서 숙주 게놈의 단편을 발견했습니다. 그런 다음 팀은 데이터베이스를 검색하여 새로운 ECE를 다른 DNA와 비교하고 몇 가지 일치 항목을 찾았습니다.

연구자들은 염색체 외 요소가 마주치는 다른 유기체로부터 DNA 단편을 받아 스타 트렉의 사이보그 이름을 따서 그를 보그(Borg)라고 명명했다고 추측합니다.

연구자들은 다른 유기체에서 DNA 조각을 수집하는 데 약간의 노력이 필요하며 이는 어떤 목적을 시사한다고 언급했습니다. 그들은 Borges가 메탄 산화를 돕기 위해 DNA를 찾고 사용하고 있다고 추측합니다. 그들은 또한 그들의 큰 크기가 한때 플라스미드나 바이러스로 존재했음을 시사한다고 생각합니다.

이 작업은 bioRxiv 사전 인쇄 서버에 게시되었습니다.


2021-07-27 05:06:44

작가: Vitalii Babkin

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