Le sequenze di amminoacidi, quando combinate tra loro, si piegano in centinaia di milioni di bizzarre forme proteiche, impossibili da prevedere, solo da studiare in laboratorio. I progressi sono stati delineati con l'avvento delle tecnologie AI in biologia e ora si sta preparando una svolta: la struttura di DeepMind di Google promette di presentare presto la forma di tutte le proteine note alla scienza, che moltiplicheranno la ricerca di nuovi farmaci e porteranno ad altri scoperte in biologia
DeepMind non è ancora riuscita a lasciare Google, ma promette di creare un database aperto di tutte le forme proteiche previste. Questo accadrà entro pochi mesi e promette di essere l'evento più ambizioso nella storia della biologia. I programmi di previsione della forma delle proteine vengono sviluppati da molte aziende e gruppi di ricerca, ma il pacchetto AlphaFold DeepMind ha mostrato la massima accuratezza nella previsione della forma. Questi strumenti sono di dominio pubblico e un database proteico già pronto faciliterà notevolmente il lavoro dei biologi di tutto il mondo: prendilo e usalo.
AlphaFold può prevedere la forma delle proteine con precisione atomica. Ma ancora meno precisione consente lo sviluppo di nuovi farmaci, fornendo informazioni sulla configurazione spaziale approssimativa di proteine precedentemente non studiate. Quindi, se negli ultimi 10 anni i biologi sono stati in grado di studiare la struttura di solo il 17% delle proteine umane, allora AlphaFold nel giro di poche settimane ha raddoppiato la base delle forme proteiche umane al 36%. Questa informazione deve ancora essere verificata, ma l'algoritmo AlphaFold ha già dimostrato la sua capacità di essere quasi sbagliato prima.
Oltre alle proteine umane, DeepMind promette di presentare le forme proteiche di 20 degli organismi più studiati, dal lievito ai moscerini della frutta, topi e altri - fino a centinaia di milioni di forme proteiche. Oggi il database di DeepMind contiene informazioni su 350mila forme proteiche previste, ma in pochi mesi sarà ampliato a più di 100 milioni di forme, dove saranno quasi tutte le proteine più o meno note alla scienza. Le proteine che assumono una forma spaziale quando combinate con altre proteine non si sono ancora prestate allo studio, ma questo sarà il prossimo dado per l'IA.
2021-07-23 18:31:10
Autore: Vitalii Babkin