Die Sequenzen von Aminosäuren falten sich, wenn sie miteinander kombiniert werden, zu Hunderten von Millionen bizarrer Proteinformen, die unmöglich vorherzusagen waren - nur im Labor untersucht werden können. Mit dem Aufkommen von KI-Technologien in der Biologie wurden Fortschritte skizziert, nun wird ein Durchbruch vorbereitet – die Struktur von Googles DeepMind verspricht, bald die Form aller der Wissenschaft bekannten Proteine darzustellen, die die Suche nach neuen Medikamenten vervielfachen und zu anderen führen werden Entdeckungen in der Biologie.
DeepMind konnte Google noch nicht verlassen, verspricht aber, eine offene Datenbank aller vorhergesagten Proteinformen zu erstellen. Dies wird in wenigen Monaten geschehen und verspricht das ehrgeizigste Ereignis in der Geschichte der Biologie zu werden. Programme zur Vorhersage der Proteinform werden von vielen Unternehmen und Forschungsteams entwickelt, aber das AlphaFold DeepMind-Paket hat die höchste Genauigkeit bei der Formvorhersage gezeigt. Diese Werkzeuge sind gemeinfrei, und eine fertige Proteindatenbank wird die Arbeit von Biologen auf der ganzen Welt erheblich erleichtern – nehmen Sie sie und verwenden Sie sie.
AlphaFold kann die Form von Proteinen mit atomarer Präzision vorhersagen. Aber noch weniger Präzision erlaubt die Entwicklung neuer Medikamente, die Aufschluss über die ungefähre räumliche Konfiguration bisher unerforschter Proteine geben. Wenn also Biologen in den letzten 10 Jahren nur die Struktur von 17% der menschlichen Proteine untersuchen konnten, dann verdoppelte AlphaFold innerhalb weniger Wochen die Basis der menschlichen Proteinformen auf 36%. Diese Informationen müssen noch überprüft werden, aber der AlphaFold-Algorithmus hat bereits zuvor bewiesen, dass er fast falsch ist.
Neben menschlichen Proteinen verspricht DeepMind, die Proteinformen von 20 der am besten untersuchten Organismen zu präsentieren, von Hefe über Fruchtfliegen, Mäuse und andere - bis hin zu Hunderten von Millionen Proteinformen. Heute enthält die DeepMind-Datenbank Informationen zu 350 Tausend vorhergesagten Proteinformen, aber in wenigen Monaten wird sie auf mehr als 100 Millionen Formen erweitert, in denen fast alle der Wissenschaft mehr oder weniger bekannten Proteine sein werden. Proteine, die in Kombination mit anderen Proteinen eine räumliche Form annehmen, eignen sich noch nicht für Studien, aber dies wird die nächste Nuss für KI sein.
2021-07-23 18:31:10
Autor: Vitalii Babkin